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FORMATION AU TRAITEMENT ET A L'ANALYSE DES DONNEES EPIDEMIOLOGIQUES
I- CONTEXTE ET JUSTIFICATION Depuis 2002, la région de l'Afrique de l'Ouest, en particulier la Guinée et
la Guinée Bissau, fait face à des épidémies de Choléra en voie
d'endémisation.
De grandes épidémies de cholera ont été respectivement enregistrées au
cours des années 1970, 1978, 1986, 1994, 1995, 2002, 2004, 2005,2006 et
2007 à travers tout le pays. |Années |2002 |2004 |2005 |2006 |2007 |2008 |2009 |
|Décès |142 |112 |107 |218 |310 |16 |0 |
|Létalité|10,43% |7,43% |2,8% |6,74% |3,62% |6,2% |0% | Les taux de létalité des épidémies successives depuis 2002 sont au delà de
la norme fixée par l'OMS (moins de 1%). Devant l'ampleur de ces épidémies, le Gouvernement et les partenaires au
développement mènent des actions conjointes de lutte pour prévenir et mieux
répondre aux épidémies de choléra.
Deux projets de prévention aux épidémies de choléra financé par la DG ECHO
mis en ?uvre de février-septembre 2009 conjointement par ACF-E et UNICEF,
avaient pour objectif de définir un mécanisme de réponse aux épidémies de
choléra à travers les activités de prévention. Un second projet financé par
la DG ECHO de préparation aux épidémies de choléra a pour objectif de
consolider les acquis des projets précédents de prévention (choix de la
méthode de traitement de l'eau, ciblage des quartiers à risque, définition
d'un kit d'hygiène...). L'aboutissement de la capitalisation des
interventions de prévention et de réponse des membres du cluster WASH et
des différents organes du Ministère de la santé publique se traduit par
l'élaboration d'un plan de contingence spécifique aux épidémies de choléra
à partir d'un modèle de réponse. C'est dans le cadre l'application pratique des plans de contingence
qu'UNICEF sollicite un financement afin de renforcer les capacités de
traitement et d'analyse des données épidémiologiques de la division
prévention et lutte contre la maladie (DPLM). En effet, au cours des
travaux effectués sur les mécanismes de réponse aux épidémies de choléra et
sur les plan de contingence, il est apparu un déficit des connaissances
pour l'analyse épidémiologique et cartographique descriptive.
II- OBJECTIF GENERAL Renforcement des capacités de 6 formateurs de la division prévention et
lutte contre la maladie en matière de traitement et d'analyse des données
épidémiologiques du choléra et des autres maladies à potentiel épidémique. III- OBJECTIFS SPECIFIQUES - Formation à l'utilisation des tableurs croisés dynamiques pour
l'analyse des données épidémiologiques
- Formation à l'investigation des cas et à la collecte des données
épidémiologiques
- Formation à l'interprétation et au traitement des données
épidémiologiques avec le logiciel Epi-Info
- Introduction aux systèmes d'informations géographiques - Formation à la cartographie des données épidémiologiques du choléra et
des autres maladies à potentiel épidémique avec un logiciel libre
d'exploitation
IV- METHODOLOGIE La formation sera faite à partir d'exposés d'introduction, de travaux de
groupe et d'exercices pratiques sur les logiciels d'exploitation. Les
thèmes suivants seront abordés : . Rappel sur le déroulement de la formation, les définitions des
enquêtes en épidémiologie et le choléra (définitions et les paramètres
clefs du choléra)
o Fiche de synthèse à faire par les participants (en groupe de
deux, noté et corrigé par le directeur de la DPLM et le
formateur)
. Formation à l'utilisation des tableurs croisés dynamiques pour
l'analyse des données épidémiologiques sous Excel 2003 et 2007 en
fonction de la disponibilité de la version du logiciel sur les
ordinateurs des participants
o Protocole d'utilisation à faire par les participants (en groupe
de deux, noté et corrigé par le directeur de la DPLM et le
formateur)
. Formation à l'investigation des cas et à la collection des données
épidémiologiques :
o Rappel sur l'investigation : retour sur les résultats de
l'atelier de septembre 2009
o Création et rédaction d'une fiche d'investigation des cas de
choléra en collaboration avec la DPLM et les participants
. Présentation de la fiche existante
. Intérêt pour l'enquête de terrain (recherche des sources de
contamination, ciblage des cas, recherches des cas
secondaires)
. Discussion autour des spécificités du milieu urbain, du
milieu littoral et des zones rurales
. Création d'une fiche spécifique (urbain, littoral, rural)
en groupe sur l'ensemble de la durée de la formation.
. Déclinaison de la fiche d'enquête pour des études des facteurs de
risques :
. présentation des études cas-témoin
(prospective/rétrospective, stratégie et méthode d'analyse
manuelle)
. Formation à l'analyse des données épidémiologiques avec le
logiciel Epi Info (avec deux exemples pratiques : données
collectées après investigation et données du système
d'alerte précoce)
. Introduction aux systèmes d'informations géographiques
o Structures des données
o Intérêts et limites de la cartographie dans les maladies à
potentiel épidémiques
. Formation à la cartographie des données épidémiologiques du choléra et
des autres maladies à potentiel épidémique avec un logiciel libre
d'exploitation (QGIS 1.3.0 'Mimas' publiée le 20 septembre 2009)*
o Installation du logiciel sur les ordinateurs des participants
o Prise en mai du logiciel et présentation du mode d'emploi et des
principaux tutoriels
o Importation des données de santé et réalisation de carte
. Exemple 1 : choléra à Conakry sur base quartier (base de
2007)
. Exemple 2 : choléra à l'échelle sous-préfectoral (exemple
de Boffa et de Boke)
. Exemple 3 : choléra aux niveaux des préfectures
o Intégration dans un rapport d'investigation
o Visite du site de mise à jour par les participants en fonction
de la disponibilité de la connexion internet
o Compilation par les utilisateurs d'un protocole simple
d'utilisation (noté et corrigé par le directeur de la DPLM et
le formateur) V- AGENDA |Contenu |Horaire indicatif |Jour de réalisation |Documents à|
| | |/participation |produire |
| | | |/remarques |
| | | | | |
|Rappel sur les définitions des enquêtes en |8 h 30 - | |J1 (45 min) Formateur | |
|épidémiologie et le choléra (définitions et les |9 h 15 | |/Directeur DPLM | |
|paramètres clefs du choléra) | | | | |
|Fiche de synthèse à faire par les participants | | | |à rendre à |
|(en groupe de deux, noté et corrigé par le | | | |J3 |
|directeur de la DPLM et le formateur) | | | | |
|Formation à l'utilisation des tableurs croisés |9 h 15 - |10h 30 - |J1 TP (2 h 15) | |
|dynamiques pour l'analyse des données |10 h 15 |11h 45 | | |
|épidémiologiques sous Excel 2003 et 2007 en | | | | |
|fonction de la disponibilité de la version du | | | | |
|logiciel sur les ordinateurs des participants | | | | |
|Protocole d'utilisation à faire par les |13 h 45 -| |J1 (45 minutes) participants|à rendre en|
|participants (en groupe de deux, noté et corrigé|14 h 30 | | |fin de |
|par le directeur de la DPLM et le formateur) | | | |journée |
|Formation à l'investigation des cas et à la | | | | |
|collection des données épidémiologiques : | | | | |
|Rappel sur l'investigation : retour sur les |14 - 30 -| |J1 présentation (45 minutes)| |
|résultats de l'atelier de septembre 2010 |15 h 15 | |Formateur | |
|Création et rédaction d'une fiche | | | | |
|d'investigation des cas de choléra en | | | | |
|collaboration avec la DPLM et les participants | | | | |
|Présentation de la fiche existante | | | | |
|Intérêt pour l'