Projets Sud-Expert-Plantes et formation RIHA

Projets Sud-Expert-Plantes et formation RIHA Compte-rendu de mission au Congo Hervé Chevillotte & Jacques Florence (IRD) 24 novembre au 12 décembre 2008
Objectifs Cette mission s'est déroulée dans le cadre des projets Sud-Expert-Plantes
d'appui aux institutions (projets 211, 213 et 214) et d'un projet de
recherche (projet 321) avec les objectifs suivants : . Mise en ?uvre de l'informatisation de l'Herbier National du Congo,
. Formation à la nomenclature botanique et au logiciel RIHA auprès des
partenaires SEP de l'Afrique centrale.
. Développement du projet « Atlas de la conservation des arbres soumis à
l'exploitation en Afrique Centrale » au Congo.
Préparation de la mission La décision d'organiser une formation RIHA sur deux semaines à Brazzaville
a été prise en septembre-octobre en concertation avec le Conseil
scientifique du SEP, le coordonnateur régional à Yaoundé (G. Achoundong) et
le Responsable de l'Herbier National du Congo (E. Kami). Un financement
spécifique a été attribué au titre de la formation pour couvrir les
missions des participants de la République démocratique du Congo et les
frais de transport des intervenants. Nous soulignerons ici l'efficacité
des services de l'IRD du Cameroun et en particulier de la régie (P.
Huyghues-Despointes) pour assurer dans des délais très courts, les diverses
commandes des matériels informatiques, l'avance sur les frais de mission et
la délégation de crédits pour les prestations de service du CERVE (Centre
d'Etudes sur les Ressources Végétales).
L'Herbier National du Congo L'Herbier National du Congo est installé dans les locaux du CERVE, sous la
responsabilité d'Emile Kami. Une première réunion avec le Directeur du
CERVE (Mathieu Ndounga) a été l'occasion de présenter les objectifs du SEP,
son fonctionnement et ses différentes composantes dont les projets d'appui
aux institutions et les projets de formation. Concernant le SEP et son
organisation, le Directeur a déploré vivement l'insuffisance des
informations sur les projets de formation dans la sous-région et l'absence
de mission auprès des partenaires de la part du coordonnateur régional (G.
Achoundong). Cette réunion a permis également de définir le contenu du
contrat de prestation de service entre l'IRD et le CERVE pour
l'organisation et la prise en charge d'une partie de la formation.
L'équipe permanente de l'Herbier National du Congo est constituée de quatre
autres personnes dont trois Attachés de recherche (Odile Saminou, Yvette
Bongou et Augustin Ngoliée) et un technicien (Gilbert Nsongola). Par
ailleurs, Jean-Marie Moutsamboté botaniste à l'Institut du Développement
Rural (IDR), et Edmond Sylvestre Miabangana botaniste, collaborent
étroitement avec l'Herbier à travers des programmes scientifiques
(inventaires floristiques de la réserve de la Lésio-Louna, du lac Télé, des
régions du Nord Ouest).
Les collections de l'Herbier sont évaluées aujourd'hui à environ 25000
parts dont une partie non négligeable est attaquée par les insectes. Il
faut signaler que les collections actuelles ont été sauvées en grande
partie de la destruction pendant la guerre de 1993-99, grâce à leur
déménagement de l'Herbier par J.-M. Moutsamboté. L'opération
d'informatisation des échantillons va permettre de faire un premier tri sur
ceux à conserver et ceux à jeter et éventuellement à remplacer par de
nouvelles collectes. Informatisation de l'Herbier National du Congo Dans le cadre des financements SEP du projet 211 (Renforcement des
capacités opérationnelles de l'Herbier National pour une meilleure
connaissance et une utilisation durable des plantes au Congo), un
dispositif client-serveur a été installé dans les locaux de l'Herbier avec
la collaboration étroite de Bégéli Bilombo, technicien de la société AiTech
qui assure la maintenance du réseau informatique du CERVE et des autres
instituts du campus, ainsi que la gestion du point d'accès VSAT pour
l'Internet.
Les ordinateurs sont des PC Desktop sous Windows XP Pro de la marque Dell
Optiplex 330 avec 2Go de mémoire, 150Go de disque dur et un processeur
double core. Ces machines sont raccordées au réseau local via un dispositif
WiFi. L'évolution des interfaces des systèmes d'exploitation et de gestion
des bases de données sous une architecture 386i permet d'envisager
aujourd'hui l'installation de versions gratuites, fiables et faciles à
maintenir. Il donc été décidé d'installer le SGBD Postgres 8.3.1. sous un
environnement Windows XP Pro. Les trois postes clients sont dotés de
l'interface RIHA sous Access 2003 et communique avec le serveur via la
version du protocole ODBC pour Postgres.
Une base de données nommée Sita en l'honneur de P. Sita, botaniste
congolais, a été crée sur le serveur. Le détail de l'installation et de la
configuration du serveur et des postes clients figure dans l'annexe 3.
La maintenance de l'architecture serveur-clients et la sauvegarde de la
base de données Sita sera assurée par B. Bilombo.
Formation à la nomenclature botanique et au logiciel RIHA 1- Formation à la nomenclature botanique La formation au code de nomenclature s'est déroulée durant toute la
première semaine, afin de permettre aux étudiants congolais de suivre au
moins la première partie consacrée à l'examen du Code de Vienne. Les trois
jours suivant étaient restreints aux dix-neuf participants dont quatre
ressortissants de la RDC. Les exercices illustrant le code ont suivi la
partie théorique durant deux jours, entrecoupée par un rapide survol de la
table référentiel taxonomique de la base RIHA et suivi par l'utilisation de
la Toile comme source de références des noms et de la bibliographie
botanique.
Nous avons ainsi passé en revue le corpus du Code - Préambule, Principes,
Règles distribués en sept chapitres. Nous avons plus particulièrement
insisté sur les deux piliers du Code de nomenclature botanique que sont la
méthode des types nomenclaturaux et le principe de priorité, ainsi que les
nombreuses conditions de validation des noms au sein d'une publication. Des
exercices gradués sont venus illustrer et faire appliquer les principales
règles.
Le passage à la table du référentiel taxonomique de RIHA a principalement
servi à illustrer la place de cette table dans le modèle de la base de
données et à illustrer par l'exemple, quelques champs-clés comme le statut
nomenclatural, citation du type, référence du type et son dépôt dans les
herbiers.
Enfin, les principaux sites concernant les collections de noms, « Lebrun et
Stork » pour l'Afrique, IPNI etc ; ou l'accès à la bibliographie : Gallica,
Tropicos ; HUH pour les collecteurs et auteurs utilisés dans RIHA en
particulier pour enrichir la table Personnes.
Parmi les questions posées par les stagiaires, il a été insisté sur la
classification des familles qui devrait être retenue pour ranger
l'herbier. Pour ce faire, nous avons procédé avec E. Kami à un rapide
examen des noms de familles utilisés dans son herbier et qu'il convenait de
corriger pour des raisons de standardisation ou de correction vis-à-vis du
Code. Mais il s'est aussi agi de trancher sur des familles qui ont été
démembrées par l'APGII. Ainsi, nous avons soumis au conservateur de
l'Herbier National du Congo, le redécoupage des Flacourtiaceae et des
Euphorbiaceae, ainsi que la conception nouvelle des Malvaceae. Nos
propositions figurent ainsi dans les annexes 4, 5 et 6. L'intégralité du
cours magistral de nomenclature botanique sera disponible au début 2009 sur
le site web de Sud-Expert-Plantes. 2- Formation au logiciel RIHA La formation au logiciel RIHA a réuni 19 participants dont 4 collègues de
la République démocratique du Congo :
. Bhely Angoboy Ilondea, assistant de recherche de l'INERA - Station
forestière de Luki,
. Joseph Omatoko, Herbier de Yangambi, district de la Tshopo,
. Anthony Kikufi , assistant de recherche à l'Herbier de Kinshasa,
. Paulin Mpungi, technicien à l'Herbier de Kinshasa. La situation de chacun des Herbiers de la RDC et de celui du Congo a été
présentée à l'ensemble des participants par les différents responsables et
leurs communications figureront sur le site web de Sud-Expert-Plantes.
Compte-tenu du nombre important de participants, deux postes
supplémentaires (deux portables) ont été ajoutés au réseau.
Cette formation a porté exclusivement sur la partie du logiciel consacrée à
la saisie des récoltes à travers l'utilisation de différents formulaires
(récoltes, personnes, localités, determinavits, collecteur, taxon
spécimen).
A l'issue de cette première semaine de formation à RIHA, il est important
de souligner que cette durée constitue un minimum pour apprendre à
interpréter les étiquettes des parts d'herbier plus ou moins complexes et
pour acquérir une assez bonne maîtrise de toutes les possibilités offertes
par l'interface RIHA. Il est donc proposé d'assurer un suivi de la saisie
informatique des spécimens de l'Herbier National du Congo où un contrôle de
validation des données sera effectué au cours de l'année 2009. Projet Atlas de la conservation des arbres soumis à l'exploitation en
Afrique Centrale (n° 321) Cette mission a permis de faire le point sur les activités déjà engagées en
2008 (référentiel taxonomique, saisie des échantillons des grands Herbiers
P et K) et de définir celles qui seront menées au Congo en 2009. Quelques
matériels ont déjà été acquis en