Cours d'épidémio #1 - Urgence CHU Sainte-Justine

Cours d'épidémio #2 Tests diagnostics et scores de sévérité Objectifs du cours :
- Savoir calculer et interpréter les sensibilité, spécificité et
valeurs prédictives
- Savoir interpréter les rapports de vraisemblance
- Comprendre et savoir interpréter une courbe ROC
- Savoir comment créer et évaluer un score de sévérité
- Notions de base sur l'évaluation de la fiabilité d'une mesure
dichotomique
- Comprendre la mesure de Bland-Altman pour les mesures continues Lecture à faire en concordance avec le cours
- Thayyil Set al., Is procalcitonin useful in early diagnosis of
serious bacterial infections in children? Acta Paediatrica 2005;
94: 155-8.
- Kharmada et al , A clinical decision rule to identify children at
low risk for appendicitis. Pediatrics 2005 ; 116 : 709-16.
http://pediatrics.aappublications.org/cgi/content/abstract/116/3/709 Exercices pratiques à faire avant le cours. Il s'agit d'exercices qui
serviront de point de départ pour les discussions. Question #1
Pourquoi est-ce que la majorité des articles sur les tests diagnostics
rapportent les valeur de sensibilité et spécificité au lieu des valeurs
prédictives positive et négative?
Question #2
Sachant que le risque de bactériémie est de 2% pour un nourrisson fébrile
et que le décompte leucocytaire a une sensibilité de 80% et une spécificité
de 60% ; quel est le risque de bactériémie chez un enfant fébrile avec des
leucocytes élevés ? Il existe au moins 2 façons de le calculer.... Question #3
Dans l'article de Thayyil, la figure 1 montre la distribution des patients
selon leur niveau de CRP ou procalcitonine et leur statut (SBI vs infection
viral possible vs infection bactérienne possible). Si on dit que le seuil
pour la procalcitonie est de 2 ng/l, pouvez vous remplir le tableau de la
distribution des patients en utilisant la figure 1 : | |Infection |Tous les autres |total |
| |sérieuse (SBI) | | |
|PCT > 2.0 (Test | | | |
|+) | | | |
|PCT < 2.0 (test | | | |
|-) | | | |
|total | | | | 3a Quelle est la valeur prédictive positive calculée?
Quelle est votre analyse de ce tableau ? Question #4
Dans l'article de Thayyil
Quel est le risque pré-test d'infection bactérienne sérieuse ?
Quel est le risque d'infection post-test si :
- la CRP est élevée (et que l'on n'a mesuré que la CRP)? Faites-les
calculs...Car l'un des participants viendra les faire au
tableau....
- Les globules blancs sont élevés (et qu'on n'a fait qu'une FSC) ?
Faites les calculs, car l'un des participants viendra les faire au
tableau.... Question #5
Dans l'article de Thayyil
Quelles sont les sensibilités et spécificités pour les 2 valeurs de
procalcitonine évaluées ?
|valeur |sensibilité |spécificité |1-spécificité |
| | | | |
| | | | | Dessinez une courbe ROC pour évaluer l'habileté de la procalcitonine à
prédire le risque d'infection bactérienne sérieuse. [pic] Question #6
6a Appliquer la grille du QUADAS à l'article de Thayil |Ite| |Yes |No |Unclear |
|m | | | | |
|[pic] |[pic] |[pic] |[pic] |
|1. |Was the spectrum of patients representative|( ) |( ) |( ) |
| |of the patients who will receive the test | | | |
| |in practice? | | | |
|2. |Were selection criteria clearly described? |( ) |( ) |( ) |
|3. |Is the reference standard likely to |( ) |( ) |( ) |
| |correctly classify the target condition? | | | |
|4. |Is the time period between reference |( ) |( ) |( ) |
| |standard and index test short enough to be | | | |
| |reasonably sure that the target condition | | | |
| |did not change between the two tests? | | | |
|5. |Did the whole sample or a random selection |( ) |( ) |( ) |
| |of the sample, receive verification using a| | | |
| |reference standard of diagnosis? | | | |
|6. |Did patients receive the same reference |( ) |( ) |( ) |
| |standard regardless of the index test | | | |
| |result? | | | |
|7. |Was the reference standard independent of |( ) |( ) |( ) |
| |the index test (i.e. the index test did not| | | |
| |form part of the reference standard)? | | | |
|8. |Was the execution of the index test |( ) |( ) |( ) |
| |described in sufficient detail to permit | | | |
| |replication of the test? | | | |
|9. |Was the execution of the reference standard|( ) |( ) |( ) |
| |described in sufficient detail to permit | | | |
| |its replication? | | | |
|10.|Were the index test results interpreted |( ) |( ) |( ) |
| |without knowledge of the results of the | | | |
| |reference standard? | | | |
|11.|Were the reference standard results |( ) |( ) |( ) |
| |interpreted without knowledge of the | | | |
| |results of the index test? | | | |
|12.|Were the same clinical data available when |( ) |( ) |( ) |
| |test results were interpreted as would be | | | |
| |available when the test is used in | | | |
| |practice? | | | |
|13.|Were uninterpretable/ intermediate test |( ) |( ) |( ) |
| |results reported? | | | |
|14.|Were withdrawals from the study explained? |( ) |( ) |( ) | 6b Appliquer la grille du QUADAS à l'article de Kharbanda |Ite| |Yes |No |Unclear |
|m | | | | |
|[pic] |[pic] |[pic] |[pic] |
|1. |Was the spectrum of patients representative|( ) |( ) |( ) |
| |of the patients who will receive the test | | | |
| |in practice? | | | |
|2. |Were selection criteria clearly described? |( ) |( ) |( ) |
|3. |Is the reference standard likely to |( ) |( ) |( ) |
| |correctly classify the target condition? | | | |
|4. |Is the time period between reference |( ) |( ) |( ) |
| |standard and index test short enough to be | | | |
| |reasonably sure that the target condition | | | |
| |did not change between the two tests? | | | |
|5. |Did the whole sample or a random selection |( ) |( ) |( ) |
| |of the sample, receive verification using a| | | |
| |reference standard of diagnosis? | | | |
|6. |Did patients receive the same reference |( ) |( ) |( ) |
| |standard regardless of the index test | | | |
| |result? | | | |
|7. |Was the reference standard independent of |( ) |( ) |( ) |
| |the index test (i.e. the index test did not| | | |
| |form part of the reference standard)? | | | |
|8. |Was the execution of the index test |( ) |( ) |( ) |
| |described in sufficient detail to permit | | | |
| |replication of the test? | | | |
|9. |Was the execution of the reference standard|( ) |( ) |( ) |
| |described in sufficient detail to permit | | | |
| |its replication? | | | |
|10.|Were the index test results interpreted |( ) |( ) |( ) |
| |without knowledge of the results of the | | | |
| |reference standard? | | | |
|11.|Were the reference standard results |( ) |( ) |( ) |
| |interpreted without knowledge of the | | |