TP-TD juin 2000.doc

UNIVERSITE DE RENNES 1 - UFR SVE Année Universitaire 1999-2000
DEUG SCIENCES (1ère année) : Sciences de la Vie (1ère Session d'examen)
Module UE4 (BIOLOGIE 2)
EPREUVE DE TRAVAUX PRATIQUES & TRAVAUX DIRIGES
N° d'anonymat : Partie Biologie et Génétique Cellulaire et Moléculaire (durée 1h10 ; 15
points) Vous répondrez aux questions directement sur ces feuilles dans les espaces
prévus à cet effet et vous les insèrerez dans une copie double à coin gommé
portant toutes les informations demandées. Vous n'oublierez pas de faire
figurer votre n° d'anonymat sur chaque feuille. Pour cette épreuve, aucun document, support de document ou support de
communication n'est autorisé. Exercice n°1 (Durée: 30 minutes) - 6 points Des chercheurs ont réalisé une coupe de foie de Pleurodèle qu'ils ont
colorée au VMP Question 1. Qu'est-ce que le VMP et à quoi sert-il? Question 2. Faites le schéma d'un noyau interphasique et de ses
constituants (soyez précis dans la légende). Question 3. Quels indices de l'activité transcriptionnelle de la cellule,
les chercheurs peuvent-ils observer sur cette coupe ?
Des chercheurs réalisent un fractionnement cellulaire à partir d'un foie
entier. Le foie d'un animal est récupéré et broyé dans un milieu
isotonique. L'extrait de broyage est filtré et le filtrat obtenu est soumis
à une première centrifugation de 600 g. Le culot contenant essentiellement
des noyaux est récupéré et le surnageant est centrifugé à 15000g (voir
figure ci-dessous). L'opération est répétée quatre fois afin d'isoler les
différents composants cellulaires. [pic]
Question 4. Comment s'appelle ce type de centrifugation ?
Question 5. Pourquoi tous les composants cellulaires ne sont pas tous
retrouvés dans le premier culot ? Question 6. Connaissez-vous une autre méthode pour séparer les organites
cellulaires par centrifugation ? Expliquez son principe.
Exercice n°2 (Durée 10 minutes) - 3 points Les figures présentées ci-dessous montrent quelques stades de la méiose
chez le criquet sud-américain Dichroplus silveira. Question 1. Déterminez le nombre haploïde de chromosomes de cette espèce.
Question 2. Appariez les chromosomes homologues. Le mâle est-il homo- ou
hétérogamétique (justifiez)?
| |[pic] |
| |Figure 2. |
| | |
|[pic] | |
| | |
| | |
| | |
|Fig. 1. Métaphase d'une | |
|spermatogonie (vue polaire) | | Question 3. A quelle phase de la méiose correspondent les clichés de la
figure 2 ?
Question 4. Classez ces figures dans l'ordre chronologique. Quel élément
vous permet de le faire ?. Question 5. Pourquoi ne trouve-t'on que 4 structures dans les figures 2A et
2B ? Qu'indique la flèche de la figure 2B ?
Exercice 3. (durée 30 minutes) - 6 points Un fragment d'ADN de 271 paires de bases (pb) présentant des sites BglII à
ses extrémités contient la séquence codante d'une protéine X impliquée dans
la longueur des canines. Le cadre de lecture ouvert est représenté par le
rectangle. [pic]
Question 1. Comment peut-on cloner ce fragment dans un plasmide qui ne
possède pas de site BglII mais présente le multisite de clonage suivant
(CarI - EcoRI - HindIII - BclI - SmaI - PstI ) justifiez ? [CarI : AGATC/T ; EcoRI : G/AATTC ; HindIII : A/AGCTT BclI : T/GATCA ; SmaI
: CCC/GGG ; PstI : CTGCA/G ; BglII : A/GATCT].
L'étude d'une pathologie rare appelée syndrome de "dracula" a montrée que
les personnes atteintes de cette maladie produisaient une protéine X plus
courte. Les séquences en acides aminés de la forme sauvage et de la forme
mutée correspondant à la zône noircie de la séquence sont les suivantes Protéine sauvage ----Leu - Val - Tyr - Ala - Phe - Trp - Ser ------ Protéine mutée ----Leu - Val - Tyr - Ala - Phe -COOH Question 2. Quelles sont les séquences d'ARN codant pour le domaine
polypeptidique sauvage ? Combien d'ARN peuvent-ils coder ce domaine ? Vous
disposez du tableau du code génétique. N° d'anonymat : Question 3. Sachant que la mutation qui conduit à la forme mutée de la
protéine correspond à une substitution et qu'elle provoque l'apparition
d'un site de restriction BclI dans la séquence, quelle est la séquence du
codon muté dans l'ADN du mutant ? Pouvez-vous déterminer la séquence du
codon Serine chez le sauvage ? Justifiez.
La masse moléculaire moyenne d'un acide aminé est de 110 daltons (Da).
Question 4. Quelle est la masse moléculaire (en daltons) de la protéine X
produite par un organisme sauvage ? Quelle est la masse de la protéine X
mutée sachant que la dernière base du codon Phe est la 151ème du fragment
d'ADN ?.justifiez vos résultats
[pic]