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Méthodes d'analyse des données multidimensionnelles avec R Commander et
Factominer
Installer les composants logiciels nécessaires
1 R Commander et FactoMineR sur les appareils de la salle de TD
Le package FactoMineR et le menu FactoMineR de R Commander ont été
installés sur (pratiquement tous) les appareils de la salle A206. Il suffit
donc de charger R (de préférence à l'aide du raccourci disponible sur le
site Web) puis d'utiliser le menu Packages > Charger le package ... >
Rcmdr. 2 R Commander et FactoMineR sur un appareil personnel On se reportera au polycopié de L3 (EC PSY54A) pour l'installation de R
Commander.
1 Installation automatique On peut ensuite installer FactoMineR en se rendant sur le site :
http://factominer.free.fr/ et en suivant les instructions données dans le
paragraphe : "Installing FactoMineR and its Graphical User Interface". Mais
ce procédé d'installation peut échouer, car il ne teste pas suffisamment la
configuration de la machine sur laquelle le package doit être installé.
Notamment, cette méthode est à proscrire si votre appareil ne fonctionne
pas sous Windows. 2 Installation en partie manuelle On peut aussi utiliser le menu Packages > Installer le(s) Package(s) de la
console de R pour installer FactoMineR et les packages qu'il utilise (au
moins "ellipse","scatterplot3d"). Ensuite, on télécharge les deux fichiers :
http://factominer.free.fr/Rcmdr-facto-fr.r et http://factominer.free.fr/add-
menu-facto-fr.txt Pour installer l'interface utilisateur (c'est-à-dire le menu), affichez le
contenu du répertoire \etc relatif à R Commander (par exemple : C:\Program
Files\R\R-2.15.1\library\Rcmdr\etc, plus généralement : \library\Rcmdr\etc\ cmdr-menus.txt
- Ouvrez le fichier \library\Rcmdr\etc\ le fichier Rcmdr-facto-fr.r En cas de messages d'erreur au chargement de R Commander :
- vérifiez dans la console si l'erreur n'est pas due à des packages
manquants. Si c'est le cas, installez ces packages ;
- si l'erreur est d'une autre nature, il est possible de revenir en arrière
en supprimant le fichier Rcmdr-facto-fr.r qui a été copié dans \library\Rcmdr\etc\Rcmdr.txt par la copie
de sauvegarde qui avait été faite. En dernier recours, on peut aussi supprimer le répertoire Analyse en composantes principales
Sélectionnez les 7 variables numériques. Utilisez le bouton "Options
graphiques" pour supprimer les sorties graphiques et le bouton "Sorties"
pour demander l'écriture des données relatives aux valeurs propres dans un
fichier nommé Valeurs-propres-ACP.csv :
[pic] [pic] On obtient le résultat suivant, qui nous conduit à étudier 2 ou 3 axes : | |eigenvalue |percentage of |cumulative |
| | |variance |percentage of|
| | | |variance |
|comp 1 |2,120921888